VI Российский национальный конгресс "Человек и лекарство"

Направление 6. Создание и внедрение новых лекарственных и медицинских технологий.

Секция 6.4. Компьютерное конструирование лекарств.

Тема: "Вычислительная техника в задачах молекулярного моделирования лекарств. Анализ тенденций."

Цель работы — анализ современных тенденций в области компьютерных технологий для задач молекулярного моделирования лекарств. Молекулярное моделирование лекарств является одной из приоритетных научных проблем следующего столетия (согласно переченя Grand Challenges). Динамичный рост достижений в компьютерной индустрии ведет к пересмотру роли вычислительных технологий в молекулярном моделировании лекарств.

Выполнен обзор компьютерных платформ Siemens (европейский производитель), Silicon Graphics (американский производитель), используемых в задачах молекулярного моделирования лекарств. Показано, что для расчета комплексных молекулярных моделей в реальном времени требуется высокая вычислительная мощность, производительная графика, высокоемкая быстрая память, скоростной ввод/вывод и большая скорость передачи данных.

Проведен анализ тенденций развития требований к вычислительной технике в задачах молекулярного моделирования лекарств. Показано, что удельная стоимость вычислений уже играет существенно меньшую роль. На смену приходят критерии органичной масштабируемости и среднее время получения конечного результата. В настоящее время на первый план выходит интеграция разнообразных информационных технологий при одновременном росте производительности системы.